Mannen, som är från Strängnäs kommun, anhölls den 7 december och häktades vid Eskilstuna tingsrätt den 10 december.
De våldtäkter han misstänks för ska ha ägt rum åren 2018 och 2020, i Strängnäs kommun och en annan kommun.
Under häktningsförhandlingen nekade mannen, som är tidigare ostraffad, till brott och begärde att han skulle släppas på fri fot.
Domstolen gick dock på kammaråklagare Anna Asklöfs linje och bedömde att det finns risk för att mannen, om han inte häktades, skulle såväl försvåra utredningen som fortsätta sin brottsliga verksamhet.
Åtal ska väckas, eller häktningen förlängas, senast den 22 december. Beslutet om häktning går att överklaga till Svea hovrätt.