Socialisten Morales är numera baserad i Argentina och hans presstalesperson avfärdar uppgifterna som del av ett "smutsigt krig" av Bolivias konservativa interimsregering inför de allmänna valen den 18 oktober.
"Före detta president Evo Morales kommer inte att kommentera de facto-regeringens smutsiga krig som skapats i valsyfte", skriver talespersonen i ett uttalande.
Uppgifterna går ut på att Morales, 60, tidvis ska ha haft med sig en numera 19-årig kvinna, identifierad bara som "N M", innan han gick i exil efter det omdiskuterade valet 2019. Regeringen säger sig ha fotografier, ljudupptagningar och meddelanden som visar att "N M" varit minderårig när de först träffade.
Kvinnan skriver dock i ett brev till Bolivias ombudsman att polisen tvingat henne att säga att hon haft ett förhållande med Morales.