Målet, uppgav juntan efter två dagar av konferens i huvudstaden Bamako, är en återgång till civilt styre.
En expertgrupp ska nu utforma regler för övergångsregeringen; presidenten i denna kommer antingen att vara en militär eller en civil person.
Beslutet är ett försök från juntans sida att blidka växande protester och internationell kritik.
Omkring 500 personer hade fått inbjudan till en konferenshall i huvudstaden Bamako för att dryfta frågor efter kuppen den 18 augusti då president Ibrahim Boubacar Keïta avsattes.
Flera grupper, bland dem den som representerar militanta tuareger, har bojkottat mötet.