Attacken genomfördes på onsdagskvällen.
Gränsstationen ligger i ett område mellan Niger och grannlandet Burkina Faso, där militanta islamistiska grupper härjar.
Uppgifterna om attacken kommer från lokala invånare, och bekräftas av säkerhetsstyrkor som dock inte vill ange hur många som dödats.
Gränsposteringen ligger nära staden Makalondi, omkring tio mil från Nigers huvudstad Niamey.
Flera oberoende, och ibland internt stridande, extremistgrupper sprider terror i regionen. Myndigheter har beslutat att delvis stänga bensinstationer för att undvika att grupperna får bränsle – och därmed försvåra deras möjligheter att genomföra attacker.
Tidigare har bland annat användande av motorcyklar delvis förbjudits i området.