Enligt armén öppnades korridoren klockan 16 svensk tid på söndagen och skulle hållas öppen i tre timmar.
Den halvmilitära RSF (Rapid Support Force) bekräftar i ett uttalande att man har gått med på åtgärden, men uppgav att korridoren skulle hållas öppen under fyra timmar.
Båda sidor säger sig behålla rätten att "reagera vid överträdelser" från den andra sidan.
Men en timme in i den avtalade pausen kunde fortfarande kraftig skottlossning höras i centrala Khartum nära flygplatsen och svart rök vällde upp från det omgivande området.
Det var i lördags som tunga strider mellan landets två rivaliserande militärmakter bröt ut och trappades upp.