För att senare diskas för att ha kommit för sent till uppropsrummet, det så kallade call room, inför tävlingen.
Zolkefli diskades efter en protest från Ukraina, vilket innebar att ukrainaren Maksym Koval fick guldet.
Ytterligare två friidrottare kom sent till uppropningsrummet och diskades. Enligt Craig Spence, talesperson för Internationella paralympiska kommittén (IPK), sade de aktiva att de inte hört uppropet eller att de inte förstod språket.
– Men alla andra aktiva kom i tid, säger Spence som försvar till beslutet om diskningarna.
Zolkeflis diskning har rört upp stämningen i sociala medier och Malaysia har lämnat in en protest.